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一行政机关2003年向一自然人出售一套住宅，当时只签定了合同，开具了收据，现自然人申报缴纳契税，税务机关是否征收增值税、土地增值税及企业所得税？

增值税：如果纳税义务发生时间在营业税期间，是需要按照规定缴纳营业税的，目前如何补缴营业税建议联系当地税务机关核实，如果纳税义务发生时间在增值税期间，按照规定申报缴纳增值税。

土地增值税：根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》（国务院令第138号）文件规定：转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物（以下简称转让房地产）并取得收入的单位和个人，为土地增值税的纳税义务人（以下简称纳税人），应当依照本条例缴纳土地增值税。

企业所得税：根据《中华人民共和国企业所得税法》规定：在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织(以下统称企业)为企业所得税的纳税人，依照本法的规定缴纳企业所得税。

因此，发生销售不动产产生的应税行为，需要按照规定缴纳相应的税种。